①登記手続
申請団体は認証を受けると2週間以内に、合併後存続する団体は「変更の登記」を、合併により消滅する団体は「解散の登記」を、合併により設立した団体には「設立登記」の申請を法務局に行います。
②合併登記完了の届出
合併に関する登記が完了したときは、次の書類を所轄庁に提出する必要があります。
| 提 出 書 類 の 名 称 又 は 種 類 | 提出部数 | 提出先 |
| 合併登記完了届書 （特定非営利活動促進法施行条例施行規則第2号様式） |
1部 | 所轄庁 |
| 合併登記をしたことを証する登記簿謄本（現在事項全部証明書） | 1部 | |
| 合併後の定款（閲覧用） | 1部 | |
| 財産目録（閲覧用） | 1部 | |
| 合併登記をしたことを証する登記簿謄本（現在事項全部証明書）の写し（閲覧用） | 1部 |